南昌工程学院拥有瑶湖和彭桥两个校区。彭桥校区始建于1958年，位于南昌市青山湖区江大南路58号，校区占地面积约123亩。其中，生活区占地面积约50亩，教学区占地面积约73亩；总建筑面积约85000㎡，教学用房建筑面积约60000㎡，教工住宅建筑面积约25000㎡。2015年彭桥校区恢复办学规划启动，2018年8月校区改造完成，8月25日校区顺利完成了军士学院从瑶湖校区到彭桥校区的整体搬迁，9月新招军士生正式入学。                                                         

重建后的彭桥校区教学条件良好，教学设备优良。校区教学楼、实验室、图书馆等教学实验设备齐全，礼堂、学生宿舍、食堂、多媒体、全覆盖校园网、医务室等综合服务完备，校区建有标准化体育场、篮球场，涵盖田径、足球、篮球、军事训练等各类体育项目和器材，满足学生日常训练需要。

彭桥校区以军士学院教育教学为主，大学科技园入驻。校区遵循“统一领导，部门负责，综合协调”的管理原则，采取学校各职能部门工作职能延伸管理的模式。

军士学院成立于2017年5月，前身为南昌工程学院军事教学部（成立于2013年3月）。学院主要承担定向培养军士生的教学与日常管理、全校军事理论教学和军事训练等工作。2013年起开始招收定向培养军士生，为海军、火箭军、武警等部队定向培养初级军士。学院现有应用电子技术、电气自动化技术、现代通信技术、汽车检测与维修技术、智能工程机械运用技术、数字媒体技术等6个专业。

南昌工程学院大学科技园依托南昌工程学院创办，先后被认定为“国家大学科技园”、“国家众创空间”、“国家小型微型企业创业创新示范基地”、“国家级科技企业孵化器”、“全省高校大学生创新创业实习基地”、“江西省大学生创业孵化基地”、“南昌市中小微企业公共服务示范平台”。目前，园区建筑面积2.3万平方米，设有种子资金600万元，在园企业和团队近120家，拥有5家“国家高新技术企业”。

站在新的历史起点上，彭桥校区将坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入贯彻落实党的二十大精神，秉承学校“自强不息、格物致知”的校训，弘扬“开拓、勤奋、求实、文明”的校风，坚定信心、团结奋斗，勇毅前行，努力为学校“升大申博”奋斗目标作出积极贡献，为携手书写全面建设社会主义现代化江西的精彩华章、走好实现第二个百年奋斗目标新的赶考之路贡献更大力量！